La frontière entre certains hauts fonctionnaires et le secteur privé semble bien mince à Bruxelles. D'après un rapport de l'association Alter-EU (Alliance for lobbying tranparencyand Ethics regulation in the European Union) publié par Liberation.fr, la pratique du pantouflage serait fréquente à la Commission européenne. Il s'agit pour un haut fonctionnaire de passer d'une administration publique à une société privé qui travaille dans le même secteur d'activité. Les risques de conflits d'intérêts sont nombreux pour Vicky Cann, rédactrice du rapport : «C'est un sujet capital pour l'Europe. C'est la question de l'influence des entreprises, de leurs intérêts, de leurs accès privilégiés. Il s'agit pour les citoyens de savoir qui a le pouvoir à Bruxelles et qui prend les décisions.»

Comme en France, la transparence sur ces données n'est pas de mise dans les institutions. Le travail des lobbies dans la sphère législative est assez mal connu. L'association Regards citoyens, avec Transparence international France, a pourtant sorti un rapport en mars 2011, affirmant que l'activité des entreprises privées à l'Assemblée nationale est beaucoup plus importante que ce qui est déclaré. On peut y voir secteur par secteur, quels lobbies ont été audition